Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LINC00587B1AMM8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms