Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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