Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SH3BP4Q9P0V3 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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SH3BP4Q9P0V3 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SH3BP4Q9P0V3 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SH3BP4Q9P0V3 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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SH3BP4Q9P0V3 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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