Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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