Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms