Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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