Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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DDX39BQ13838 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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DDX39BQ13838 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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DDX39BQ13838 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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DDX39BQ13838 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
DDX39BQ13838 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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