Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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CDH18Q13634 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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CDH18Q13634 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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