Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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