Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3B2Q13367 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms