Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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NME3Q13232 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NME3Q13232 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NME3Q13232 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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