Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms