Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms