Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRDP23468 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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