Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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