Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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HOXA2O43364 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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