Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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LRRTM2O43300 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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LRRTM2O43300 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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