Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EHD3Q9NZN3 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms