Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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HMGN3Q15651 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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HMGN3Q15651 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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HMGN3Q15651 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HMGN3Q15651 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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