Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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