Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RUNX3Q13761 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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