Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CUL4BQ13620 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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