Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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