Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SP140Q13342 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SP140Q13342 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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