Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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IFT88Q13099 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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