Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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