Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXC1Q12948 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms