Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms