Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ACTBP60709 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ACTBP60709 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ACTBP60709 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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