Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RFXAPO00287 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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