Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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