Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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