Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IHHQ14623 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms