Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms