Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BPTFQ12830 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms