Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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LMOD1P29536 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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LMOD1P29536 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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LMOD1P29536 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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LMOD1P29536 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
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LMOD1P29536 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMOD1P29536 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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