Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB5AP20339 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms