Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms