Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NRF1Q16656 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms