Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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FXNQ16595 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FXNQ16595 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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