Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SGCAQ16586 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SGCAQ16586 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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