Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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