Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IHHQ14623 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IHHQ14623 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IHHQ14623 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
IHHQ14623 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IHHQ14623 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
IHHQ14623 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IHHQ14623 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms