Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCOF1Q13428 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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