Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KCNH2Q12809 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms