Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms