Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSFA2P28290 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SSFA2P28290 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms