Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRDP23468 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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