Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRBP23467 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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