Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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